Program unggulan di MTsN 4 Kuningan yaitu Tahfidz. Siswa-siswi melakukan rutinitas kegiatan Murojaah setiap sebelum memulai kegiatan belajar mengajar di kelas. Disamping kegiatan rutinitas di kelas, siswa-siswi bisa mengikuti ekstrakurikuler tahfidz, untuk menjadikan siswa-siswi yang hafal al-quran.